Nextera™ DNA Sample Prep Kits (イルミナ社対応)

アプリケーション

• イルミナ社Genome Analyzer用のDNAライブラリーの調製

Nextera™ DNA Sample Prep Kits (Illumina社対応)は、イルミナ社Genome Analyzer I及びIIに対応したゲノムDNAライブラリーを調製するためにデザインされています。Nextera technologyはin vitro transposition*を採用しており、フラグメント化とタグ付けを1チューブで同時に行うことができます。従来の手法（nebuｌization、ソニケーション、シェアリング）に比べ、Nextera technologyを用いたライブラリー調製手法は大きな利点があります。 (Table 1).

利点

• 初発DNA量は50 ngから可能
• 2時間以内でライブラリー調製可能
• システムに対応したタグが含有（オプションでバーコードを付加可能）(Fig. 1)
• イルミナ社GAI及びGAIIで確認済み

*Covered by issued and/or pending patents.

Roche/454-Compatible

Figure 1 イルミナ社Genome Analyzerプラットフォームのためのライブラリー作製工程。

シーケンスプライマーサイト（青とオレンジ部分）を含むNextera™ Enzyme MixによるゲノムDNAのフラグメント化とタグ付けされます。

4つのプライマーを用いたサイクル数を限定した PCRによりbPCRに対応したアダプター配列(紫色とピンク色)が付加されます。

オプションとしてbPCRアダプター(ピンク色)の下流とcore sequencing library adaptor(オレンジ色)との間にバーコード配列(三角印)を挿入することができます。イルミナ社対応のライブラリーには代替のシーケンスプライマーが必要になります；Read 1 (青色/灰色矢印); Read 2 (オレンジ色/灰色矢印); Index Read (灰色/オレンジ色矢印).

Table 1. ライブラリー調製の比較

※ステップでは、サンプルを他のチューブへ移す必要があります。

Contents: Nextera Enzyme Mix (Illumina-compatible), 5X Nextera Reaction Buffer (LMW), 5X Nextera Reaction Buffer (HMW), 50X Nextera Primer Cocktail (Illumina-compatible), 50X Nextera Adaptor 2 (Illumina-compatible), 200X Nextera Read 1 Primer, 200X Nextera Read 2 Primer, 200X Nextera Index Read Primer, Nextera Control DNA, and 2X Nextera PCR Buffer.

*注意: Nextera™ PCR Enzymeは、どのNextera DNA Sample Prep Kitを使用する場合にも必要となります。

Contents: Nextera PCR Enzyme (20 μl).

注意: Nextera Bar Codesはオプションです。各キットは12 bar codeを含みます。50ライブラリー作製に使用できます。

プロトコール

Nextera™ DNA Sample Prep Kit （Illumina社対応)

ポスター

CHI XGen Congress 2010

Plant and Animal Genome XVIII Conference, January 2010

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