Nextera™ DNA Sample Prep Kits (Roche社 454対応)

アプリケーション

• Roche社 454™ GS FLX 及びGS FLX Titanium™シーケンサー用のDNAライブラリーの調製

Nextera™ DNA Sample Prep Kits (Roche社 454対応)は、Roche社 454 GS FLX 及びGS FLX Titaniumに対応したゲノムDNAライブラリーを調製するためにデザインされています。Nextera technologyはin vitro transposition*を採用しており、フラグメント化とタグ付けを1チューブで同時に行うことができます。従来の手法（nebulization、ソニケーション、シェアリング）に比べ、Nextera technologyを用いたライブラリー調製手法は大きな利点があります。 (Table 1).

利点

• 初発DNA量は50 ngから可能
• 2時間以内でライブラリー調製可能
• システムに対応したタグが含有（オプションでバーコードを付加可能）(Fig. 1)
• Roche社454 GS FLX及びGS FLX Titaniumで確認済み

*Covered by issued and/or pending patents.

Roche/454-Compatible

Figure 1 Roche 454™ プラットフォームのためのライブラリー作製工程。

Nextera™ Enzyme MixによるゲノムDNAのフラグメント化とタグ付け後、Roche社 454に対応したアダプター配列（青とオレンジ）を加えるため4つのプライマーを用いてサイクル数を限定したPCRを行います。

オプションのバーコード（青色三角）は、エマルジョンPCR(emPCR)アダプター配列とトランスポゾン末端（灰色）の間に付加されます。

Table 1. ライブラリー調製の比較

※ステップでは、サンプルを他のチューブへ移す必要があります。

Contents: Nextera Enzyme Mix (Roche FLX-Compatible), 5X Nextera Reaction Buffer (LMW), 5X Nextera Reaction Buffer (HMW), 50X Nextera Primer Cocktail (Roche FLX-Compatible), 50X Nextera Adaptor 1 (Roche FLX-Compatible), Nextera Control DNA, and 2X Nextera PCR Buffer.

Contents: Nextera Enzyme Mix (Roche Ti-Compatible), 5X Nextera Reaction Buffer (LMW), 5X Nextera Reaction Buffer (HMW), 50X Nextera Primer Cocktail (Roche Ti-Compatible), 50X Nextera Adaptor 1 (Roche Ti-Compatible), Nextera Control DNA, and 2X Nextera PCR Buffer.

*注意: Nextera™ PCR Enzymeは、どのNextera DNA Sample Prep Kitを使用する場合にも必要となります。

Contents: Nextera PCR Enzyme (20 μl).

注意: Nextera Bar Codesはオプションです。各キットは12 bar codeを含みます。50ライブラリー作製に使用できます。

プロトコール

Nextera™ DNA Sample Prep Kit (Roche FLX対応)

Nextera™ DNA Sample Prep Kit (Roche Titanium対応)

ポスター

CHI XGen Congress 2010

Plant and Animal Genome XVIII Conference, January 2010

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