Ribo-Zero™ Gold Kit (Human/Mouse/Rat)
アプリケーション
- ヒト、マウス、ラットのtotal RNAから細胞質リボソーマルRNA(rRNA)およびミトコンドリアrRNAの両方を除去します。
Ribo-Zero™ Gold Kit (Human/Mouse/Rat) は、Epicentre社の従来の Ribo-Zero rRNA Removal Kit (Human/Mouse/Rat)の改良バージョンです。Ribo-Zero Gold Kitは、1-5 μgのヒト、マウス、ラットのtotal RNAサンプルから細胞質(nuclear-encoded) rRNA とミトコンドリアrRNAの両方を除去できます。(Table 1 and Fig. 1) rRNAを除去したRNA（rRNA-depleted RNA）は、RNA-Seqやrandom-primed cDNA合成、その他のRNA解析アプリケーションに最適です。
利点
- インタクトRNAおよび部分的に分解したRNAの両方に使用できます。
- whole-transcriptome RNA-SeqのためのmRNAおよびsmall ncRNAやlarge ncRNAを回収できます。
- 90-120分のシングルパスプロセス
- 部分的に分解したRNAサンプルにおいて全ての非リボソーマルRNAフラグメントを回収できます。
Table 1. Ribo-Zero™ Gold Kit を用いたrRNA-depleted RNAの標準的な収量reaction.
実際の収量はインプットRNAの品質、rRNAの含有量により異なります。 インプットRNAの3%-10%の収量が標準です。
| 1反応あたりのRNA量 | 標準的なrRNA-Depleted RNAの収量 |
| 1 μg | 30-100 ng |
| 2.5 μg | 75-250 ng |
| 5 μg | 150-500 ng |
Figure 1. Ribo-Zero (A)およびRibo-Zero Gold (B) Kitで処理した後に調製したRNA-seqライブラリーのプロファイル
MCF-7細胞のTotal RNAはRibo-Zero rRNA Removal Kit、もしくはRibo-Zero Gold Kitで処理しまし、ScriptSeq™ Kit を用いてRNA-Seqライブラリーを調製しました。ライブラリーは、Illumina® GAIIおよびHiSeq 2000 シーケンサーでシーケンスされました。 Data courtesy Vladimir Benes and Jonathon Blake, EMBL GeneCore, Heidelberg, Germany.
| 製品名 | Catalog No. | Size |
| Ribo-Zero™ Gold Kit (Human/Mouse/Rat)(non-magnetic) | RZHM11106 | 6 Reactions |
| Ribo-Zero™ Magnetic Gold Kit (Human/Mouse/Rat) | MRZG126 | 6 Reactions |
アプリケーションノート
- MMLV Reverse Transcriptase 1st-Strand cDNA Synthesis Kit
- MMLV High Performance Reverse Transcriptase
- Poly(A) Polymerase Tailing Kit
- Ribo-Zero™ rRNA Removal Kit (Gram-Negative Bacteria)
- Ribo-Zero™ rRNA Removal Kit (Gram-Positive Bacteria)
- Ribo-Zero™ rRNA Removal Kit (Human/Mouse/Rat)
- Ribo-Zero™ rRNA Removal Kit (Human/Mouse/Rat) Low Input
- Ribo-Zero™ rRNA Removal Kit (Meta-Bacteria)
- Ribo-Zero™ rRNA Removal Kit (Plant Leaf)
- Ribo-Zero™ rRNA Removal Kit (Plant Seed/Root)
- Ribo-Zero™ mRNA-Seq Library Preparation Kit (Illumina®-compatible)
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